Глобальна та регіональна молекулярна епідеміологія ВІЛ-1 протягом 1990-2024 років: систематичний огляд, глобальне опитування та аналіз поширеності

Вступ

Нещодавнє дослідження, опубліковане вІнфекційні хвороби від журналу The Lancet(2026) пропонує найповніший на сьогодні глобальний аналіз молекулярної епідеміології ВІЛ-1, об'єднуючи дані систематичного огляду та всесвітнього дослідження молекулярного спостереження.

Поєднавши раніше доступні набори даних (1990–2021) з нещодавно зібраними даними послідовностей, дослідження врахувало понад1,39 мільйона записів генотипування ВІЛ-1 зі 154 країн, зібраних між 1990 і 2024 рокамиВикористовуючи оцінену ЮНЕЙДС кількість людей, які живуть з ВІЛ, як вагові коефіцієнти, дослідники створили глобальні та регіональні карти, що описують часовий та географічний розподіл підтипів ВІЛ-1, циркулюючих рекомбінантних форм (ЦРФ) та унікальних рекомбінантних форм (УРФ).

Результати дослідження показують, що хоча глобальний ландшафт підтипу ВІЛ-1 залишався відносно стабільним протягом останніх двох десятиліть, відбуваються суттєві регіональні зрушення, особливо через зростання різноманітності та поширення рекомбінантних форм.

Дослідження

Вірус імунодефіциту людини 1 типу (ВІЛ-1) демонструє широке генетичне різноманіття завдяки високій частоті мутацій, здатності до рекомбінації та довгостроковій динаміці передачі.

Ця генетична мінливість має важливі наслідки для:

• · молекулярний нагляд,
• · оцінка діагностичної ефективності,
• · моніторинг резистентності до антиретровірусних препаратів,
• · та стратегії розробки вакцин.

Дослідження мало на меті охарактеризувати глобальні та регіональні закономірності поширення підтипів ВІЛ-1 та рекомбінантних форм з1990–2024 рр., що забезпечує оновлену молекулярно-епідеміологічну основу для глобальної профілактики та контролю ВІЛ.

Дизайн та методи дослідження

Дослідники провели систематичний огляд баз даних PubMed, Embase, Global Health, CINAHL, охоплюючи дослідження, опубліковані в період з 1 січня 2022 року по 22 січня 2025 року.

Крім того, дані були зібрані через мережу Глобальної співпраці з молекулярної епідеміології ВІЛ.

Відповідні набори даних включені:

• · Інформація про молекулярний підтип ВІЛ-1,
• · чітко визначені місця відбору проб,
• · дати збору,
• · та достатня кількість зразків.

Остаточний набір даних включав:

• · 1 395 222 записи генотипування ВІЛ-1 
• · 154 країни 
• · шість епідеміологічних періодів:1990–1999, 2000–2004, 2005–2009, 2010–2014, 2015–2019, 2020–2024.

Глобальну та регіональну поширеність генетичних форм ВІЛ-1 оцінювали за допомогою методів зважування, скоригованих UNAIDS.

Глобальний розподіл підтипів ВІЛ-1: підтип C залишається домінуючим

Протягом2020–2024 рр., підтип C залишався домінуючою лінією ВІЛ-1 у всьому світі, що пояснює:

Загалом, рекомбінантні форми (включаючи CRF та URF) становили приблизно22,4% світових випадків зараження ВІЛ-1, що підкреслює зростаючу складність генетичного різноманіття ВІЛ-1.

Підтип C продовжує домінувати переважно в:

• · Південна Африка,
• · Південна Азія,
• · та кілька країн Східної Африки.

Оскільки на ці регіони припадає значна частка світового тягаря ВІЛ, домінування підтипу С сильно впливає на його поширення у світі.

Регіональні відмінності: різні еволюційні моделі на різних континентах

Хоча глобальна структура ВІЛ-1 видається відносно стабільною, регіональні моделі зазнають суттєвих змін.

Південна Африка та Південна Азія: стійке домінування підтипу C

Південна Африка та Південна Азія залишаються сильно характеризуваними циркуляцією підтипу С.

У цих регіонах з високим навантаженням підтип С становить переважну більшість циркулюючих вірусів, що робить його основним фактором глобальної поширеності підтипу С.

Однак, дослідження також підкреслює, що охоплення молекулярним відбором у деяких регіонах з високим навантаженням залишається обмеженим, що свідчить про необхідність додаткових зусиль спостереження для кращого охоплення місцевого вірусного різноманіття.

Північна Америка та Латинська Америка: продовження домінування підтипу B

Підтип B залишається основною циркулюючою лінією у:

• · Північна Америка,
• · Латинська Америка.

Ці регіони демонструють відносно стабільні молекулярно-епідеміологічні закономірності порівняно з регіонами, які зазнають швидших переходів від одного підтипу до іншого.

Західна та Центральна Європа: Збільшення генетичного різноманіття

Західна та Центральна Європа переживають поступовий перехід від епідемії переважно підтипу B до більш різноманітного вірусного ландшафту.

Ключові тенденції включають:

• · зменшення частки підтипу B,
• · зростання внеску рекомбінантних форм,
• · зростання присутності не-B ліній.

Ці зміни вказують на те, що молекулярна різноманітність ВІЛ-1 стає дедалі важливішою навіть в регіонах, де історично домінував підтип B.

Східна Азія: Швидке поширення рекомбінантних форм

Східна Азія продемонструвала один із найбільш значних епідеміологічних зрушень.

Дослідження показало, що:

• · CRF07_BC суттєво збільшився з часом,
• · підтип B помітно знизився.

CRF07_BC збільшився приблизно зз 13,1% у період з 2000 по 2004 рік до 48,1% у період з 2020 по 2024 рік, що демонструє суттєві зміни в регіональній молекулярній епідеміології ВІЛ-1.

Ця трансформація підкреслює важливість безперервного молекулярного спостереження в регіонах, де рекомбінантні форми стають домінуючими.

Рекомбінантні форми: зростаючий компонент глобального різноманіття ВІЛ-1

Частка рекомбінантних форм зросла в усьому світі протягом попередніх десятиліть:

• · 2000–2004: приблизно 20,8%
• · 2010–2014: приблизно 24,2%
• · 2020–2024: приблизно 22,4%

Хоча глобальна частка дещо знизилася за останній період, рекомбінантні форми продовжують поширюватися в кількох регіонах, зокрема:

• · Східна Азія,
• · Західна та Центральна Європа.

Дослідження показує, що рекомбінантні форми все ще можуть бути недооцінені в деяких умовах, оскільки багато програм спостереження спираються переважно на часткові геномні області, які можуть не повністю ідентифікувати складні патерни рекомбінації.

Тому посилення підходів до геномного спостереження буде важливим, особливо в регіонах з високим тягарем передачі ВІЛ та зростаючою вірусною різноманітністю.

Громадське здоров'я та клінічні наслідки

1. Діагностичні системи потребують постійної перехресної оцінки підтипів

Зростання генетичної різноманітності ВІЛ-1 підкреслює важливість постійної оцінки діагностичних технологій для різних вірусних середовищ.

Хоча сучасні платформи діагностики ВІЛ та тестування вірусного навантаження продемонстрували широке застосування, постійна валідація щодо нових підтипів та рекомбінантних форм залишається важливою.

Майбутнє спостереження повинно включати:

• · молекулярна епідеміологія,
• · моніторинг діагностичної ефективності,
• · та аналіз вірусної еволюції.

2. Спостереження за лікарською стійкістю потребує ширшого генетичного охоплення

Розширення різноманітних ліній ВІЛ-1 може впливати на виникнення, виявлення та інтерпретацію мутацій, пов'язаних з резистентністю.

Деякі дослідження показали, що специфічні лінії ВІЛ-1, включаючи варіанти, пов'язані з A6/A1, можуть бути пов'язані з підвищеним ризиком вірусологічної невдачі при певних умовах лікування каботегравіром/рилпівірином тривалої дії.

Однак на результати резистентності впливає багато факторів, зокрема:

• · мутації базової резистентності,
• · історія лікування,
• · дотримання,
• · та вірусний генетичний фон.

Таким чином, епіднагляд за резистентністю з урахуванням підтипів залишається дедалі важливішим.

3. Розробка вакцини повинна враховувати регіональне вірусне різноманіття

Широке генетичне різноманіття ВІЛ-1 залишається однією з головних проблем розробки вакцини.

Зміна розподілу підтипів та рекомбінантних форм підкреслює необхідність стратегій вакцинації, які враховують:

• · регіонально циркулюючі штами,
• · вірусні еволюційні тенденції,
• · та ширше імунне охоплення.

Глобально єдиний підхід може не повністю враховувати різноманітність ВІЛ-1, що циркулює у світі.

Висновок

Цей знаковий глобальний аналіз молекулярної епідеміології ВІЛ-1 демонструє, що світовий вірусний ландшафт характеризується як безперервністю, так і змінами.

Хоча підтип C продовжує становити майже половину світових випадків ВІЛ-1, регіональні молекулярні структури швидко розвиваються, причому рекомбінантні форми все частіше впливають на епідемії в таких регіонах, як Східна Азія та Європа.

Отримані результати підкреслюють важливість сталого молекулярного спостереження, перехресної підтипової діагностичної валідації та інтегрованих геномних підходів для підтримки ефективної профілактики ВІЛ, моніторингу лікування та розробки майбутніх вакцин.

Довідка

1. Глобальна та регіональна молекулярна епідеміологія ВІЛ-1 протягом 1990–2024 років: систематичний огляд, глобальне опитування та аналіз поширеності. Інфекційні хвороби від журналу The Lancet, 2026.