Багатонаціональна відповідь на кластер хантавірусу в Андах: NAAT та секвенування всього геному як критично важливі інструменти

У квітні 2026 року круїзне судно полярної експедиції під прапором НідерландівМС Хондіусвилетів з Ушуайї, Аргентина. 6 квітня у пасажира підвищилася температура та головний біль, і через п'ять днів він помер на борту. Його дружина також захворіла та померла після перевезення до Південної Африки. Згодом 69-річний британський пасажир отримав позитивний результат на хантавірус і залишається у відділенні інтенсивної терапії. Станом на 13 травня Всесвітня організація охорони здоров'я повідомила11 випадків захворювання та 3 смертіпов'язаний зі спалахом на кораблі.

I. Огляд вірусів та патогенні типи

Хантавіруси – це група РНК-вірусів, що переносяться переважно гризунами, що належать до роду Orthohantavirus родини Bunyaviridae. Їхній геном складається зтри сегменти (L, M та S), що кодують РНК-залежну РНК-полімеразу, глікопротеїни та нуклеокапсидний білок відповідно. За географічним поширенням та клінічними проявами хантавіруси класифікуються надві основні групи:

Хантавіруси Старого Світу(зустрічається в Європі, Азії та Африці) викликаєГеморагічна лихоманка з нирковим синдромом (ГЛНС)До репрезентативних вірусів належать вірус Хантаан (HTNV), вірус Сеула (SEOV) та вірус Пуумала (PUUV). Вони вражають переважно нирки, що призводить до порушення функції нирок, геморагічних проявів, а у важких випадках – до шоку. Рівень летальності залежить від типу вірусу, але зазвичай коливається від<1% до 5-15%.

Хантавіруси Нового Світу(циркулює в Північній та Південній Америці) викликаєХантавірусний легеневий синдром (HPS)До репрезентативних вірусів належать вірус Sin Nombre (SNV) та вірус Andes (ANDV). Вони вражають переважно легені, спричиняючи швидкий некардіогенний набряк легень, тяжку респіраторну недостатність та серцево-судинні порушення. Початкові симптоми схожі на грип (лихоманка, міалгія, шлунково-кишкові скарги), але захворювання може швидко прогресувати до дихальної недостатності.рівень летальності сягає 30-50%.

Спалах на круїзних лайнерах був спричинений головним чиномВірус Анд (ANDV), що належить доХантавірусний легеневий синдром (HPS)підтип.

II. Традиційні хантавіруси, асоційовані з HFRS, проти вірусу Анд (HPS)

Традиційний HFRS

III. Способи передачі

Хантавірус передається переважно черезпрямий контакт з фекаліями, слиною або сечею заражених гризунівабо за допомогоювдихання аерозольних екскрементівІнші можливі маршрути включають:

- Укуси або подряпини заражених гризунів;

-Вживання їжі, забрудненої сечею, послідом або слиною заражених гризунів;

- Дотик до очей, носа або рота після контакту із забрудненими предметами.

Передача від людини до людини відбувається вкрай рідко, але було підтверджено дляВірус Анд (ANDV).

IV. Глобальне відстеження контактів хантавірусу – тестування та секвенування нуклеїнових кислот як ключові технології

Після спалаху вірусу дерматиту та венозної венозної хвороби (ANDV) органи охорони здоров'я у понад десяти країнах, включаючи Іспанію, Велику Британію, Сполучені Штати, Канаду та Швейцарію, одночасно розпочали відстеження контактів та моніторинг карантину. Франція, Сполучені Штати та інші країни продовжують відстежувати стан здоров'я своїх громадян, які повернулися з ураженого судна.

У цьому багатонаціональному реагуванні на надзвичайні ситуації,тестування нуклеїнових кислот та геномне секвенуваннявідіграли незамінну ключову роль:

-Тестування нуклеїнових кислотнадає остаточні докази для швидкої ідентифікації патогена;

-Геномне секвенуванняпропонує незамінні молекулярні докази для відстеження джерела інфекції, підтвердження ланцюгів передачі та оцінки вірусних змін.

V. Розчини для виявлення хантавірусу (особливо типу HPS)

1. Рання ідентифікація патогена

1.1 Тестування в місці надання медичної допомоги (POCT)
Точний скринінг та екстрене тестування –від зразка до результату за 1 годину.
Діагностичні проблеми та швидкі молекулярні рішення Тестування за місцем надання медичної допомоги
1.2 Звичайна ПЛР
Звичайна ПЛР

2. Розчини для секвенування

Для ідентифікації збудників та відстеження спалахів у випадкахлихоманка невідомого походження, респіраторний дистрес або геморагічні прояви.
геморагічні прояви

Основні характеристики:

Основні функції

VI. Перевірені дані про продуктивність

Досягнуто секвенування всього геному на основі захоплення зондів у зразках, позитивних на хантавірус>99% покриття геному на глибині 30×.
Перевірені дані про ефективність

Генотипування хантавірусу та аналіз пропорції підтипів на основі стічних вод є можливим.
пропорція підтипів

VII. Супутні комплекти

Супутні набори


Час публікації: 14 травня 2026 р.