Спалах ротавірусу групи С у початковій школі в Лучжоу, Китай, та технологія повного секвенування геному Macro & Micro-Test дозволяє точно відстежувати джерело.

Нещодавно,Щотижневик CDC Китаюопублікувала важливу дослідницьку статтю, в якій описується епідеміологічне та етіологічне розслідування спалаху гострого гастроентериту, спричиненого ротавірусом групи С (РВК) у початковій школі в Лучжоу, провінція Сичуань, у жовтні 2025 року. Зокрема, високопродуктивний набір для цільового захоплення патогенів (захоплення зондом) та технологія секвенування збагачення всього геному від Macro & Micro-Test відіграли ключову роль у розслідуванні. Забезпечуючи точну ідентифікацію патогенів та комплексну геномну характеристику, ця технологія надала критично важливі наукові докази для швидкого підтвердження спалаху, точного відстеження джерела та ефективного контролю спалахів.

Макро-мікротест

Раптовий спалах: перший зареєстрований спалах респіраторного кандидозу (РВК) на південному заході Китаю

15 жовтня 2025 року в початковій школі в Лучжоу стався спалах гострого гастроентериту. У школі навчалося 1943 учні та співробітники, було зареєстровано 32 випадки, включаючи 6 лабораторно підтверджених та 26 клінічно діагностованих випадків, що призвело до загального рівня захворюваності 1,65%. Спалах досяг піку між 15 та 16 жовтня, причому найвищий рівень захворюваності спостерігався у 7-му та 5-му класах (23,08%). Більшість пацієнтів були дітьми шкільного віку (середній вік: 10 років), які переважно мали блювання (65,62%), діарею (46,87%) та біль у животі (37,50%). Симптоми зазвичай тривали 1–3 дні, і всі пацієнти одужали без серйозних ускладнень.

Перше повідомлення про RVC

Епідеміологічне розслідування визначило індексний випадок як 11-річного хлопчика у 7 класі 5 класу. У його молодшої сестри раніше за нього розвинулися подібні симптоми, що свідчить про побутову передачу як початкове джерело. Неадекватне управління блювотними масами на території кампусу, включаючи пряме підмітання та утилізацію без своєчасної дезінфекції або ізоляції приміщення, у поєднанні з поганою гігієною рук серед учнів, ймовірно, сприяло подальшій передачі. Більшість уражених класів розташовувалися між другим і п'ятим поверхами та користувалися спільними суміжними чоловічими туалетами, що свідчить про те, що поширенню могли сприяти як аерозольний, так і контактний шлях передачі.

Розслідування стало особливо складним, оскільки рутинне скринінгування на патогени, включаючи тести на норовірус та ротавірус групи А, дало негативні результати, що вказувало на те, що відповідальним був незвичайний патоген.

Етіологічний діагноз: повногеномне секвенування за допомогою макро- та мікротесту ідентифікує винуватця

Початкове тестування на норовірус виявилося негативним. Згодом Центр контролю та профілактики захворювань Лучжоу застосував мультиплексний ПЛР у реальному часі для виявлення шлунково-кишкових патогенів, здатний одночасно виявляти 28 патогенів, включаючи 8 вірусів, 17 бактерій та 3 паразитів, для скринінгу восьми клінічних зразків. 17 жовтня шість зразків отримали позитивний результат на ротавірус групи C, що дозволило успішно ідентифікувати збудника.

Для подальшого відстеження джерела спалаху дослідники виконали як метагеномне секвенування з нанопорами, так і секвенування збагачення всього геному за допомогою захоплення зондів за допомогою Macro & Micro-Test на п'яти позитивних зразках. Цей підхід успішно створив п'ять повних послідовностей геному RVC (SC01–SC05). Інтегрована стратегія швидкого мультиплексного ПЛР-скринінгу з подальшим секвенуванням усього геному високої роздільної здатності забезпечила надійну технічну підтримку для точної молекулярної епідеміології та відстеження джерел.

Наукові висновки: Перша ідентифікація генотипу M2 на південному заході Китаю

На основі високоякісних даних усього геному, отриманих за допомогою технології Macro & Micro-Test, дослідницька група повідомила про кілька важливих наукових висновків:

Підтвердження моноклонального спалаху:Усі п'ять вірусних ізолятів мали ідентичний генотип усього геному (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2) з відмінностями лише від 0 до 1 в однонуклеотидному поліморфізмі (SNP), що переконливо демонструє, що спалах виник з одного ланцюга передачі.

Відкриття генотипу M2:Філогенетичний аналіз показав, що штами RVC Лучжоу належать до генотипу M2, а не до генотипу M3, який раніше вважався домінуючим серед китайських штамів RVC. Це відкриття ставить під сумнів традиційне розуміння розподілу генотипу RVC у Китаї та підтверджує появу генотипу M2 на південному заході Китаю.

Докази міжнародних ліній передачі:Порівняння всього геному продемонструвало високу генетичну схожість між штамами Лучжоу та штамами РВК, про які раніше повідомлялося в Юньнані (2025), Новосибірську, Росія (2017) та Італії (2012), що свідчить про існування активної євразійської мережі передачі.

 

Докази міжнародних ліній передачі

Наслідки для профілактики та контролю: раннє виявлення та швидке втручання є надзвичайно важливими

Після ідентифікації збудника, Центр контролю та профілактики захворювань Лучжоу негайно вжив комплексних заходів боротьби, включаючи ізоляцію випадків, дезінфекцію навколишнього середовища, стандартизоване управління блювотними масами та тимчасове призупинення занять. Спалах було успішно локалізовано протягом одного інкубаційного періоду, без зареєстрованих додаткових випадків після 21 жовтня.

Розслідування також дає важливий урок для громадського здоров'я: у разі спалахів кластерного гастроентериту, які мають негативний результат тесту на ротавірус групи А та норовірус, ротавірус групи С та інші ротавіруси, що не належать до групи А, слід включати до рутинного діагностичного скринінгу.

Це дослідження являє собою перший зареєстрований спалах ротавірусу групи C на південному заході Китаю та першу ідентифікацію генотипу M2 у регіоні, що розширює сучасне розуміння епідеміології ротавірусу групи C у Східній Азії. У цьому дослідженні інтегроване рішення Macro & Micro-Test, що поєднує мультиплексний ПЛР-скринінг із секвенуванням для збагачення всього геному, продемонструвало значну практичну цінність, забезпечивши як швидку ідентифікацію патогенів, так і молекулярне відстеження джерел з високою роздільною здатністю, забезпечуючи відтворювану технічну основу для точного дослідження та контролю майбутніх спалахів інфекційних захворювань.

 


Час публікації: 30 липня 2026 р.